De meeste directieleden werken al bij OCW en stromen door. Nieuw is dat het ministerie zijn directeuren voor maximaal vijf jaar benoemt. Van der Hoeven en secretaris-generaal Van der Steenhoven beklaagden zich bij hun aantreden - vlak na het einde van Paars II - over de werkcultuur op het departement en kondigden een grondige reorganisatie aan. Het ministerie ging de afgelopen jaren gebukt onder tal van affaires als de hbo-fraude, de Jamby affaire en de `graaicultuur' onder hoge ambtenaren.
De nieuwe directeur hoger onderwijs is Jo van Ham, directeur primair onderwijs van het ministerie. Hij wisselt van functie met (waarnemend) directeur Ron Minnée.
