Sinds 2014 is Habibovic hoogleraar in Maastricht. Daarvoor was ze verbonden aan de UT, de McGill University in Montreal en de Harvard Medical School in Boston. Habibovic leidde als voorzitter ook de European Society for Biomaterials, wereldwijd een van de grootste verenigingen in dat vakgebied.
In 2005 promoveerde ze in Twente in de biomedische wetenschappen. Van 2008 tot en met 2012 was ze universitair docent op de UT, vervolgens twee jaar universitair hoofddocent. Ze was verbonden aan de vakgroep tissue regeneration binnen het toenmalige MIRA-onderzoeksinstituut en zat in het bestuur van het Female Faculty Network Twente.
Habibovic begint op 1 februari 2022 als rector in Maastricht.
